این آزمایشگاه در طبقه اول دانشکده قرار دارد و اختصاص به تحقیقات عملی در مقاطع ارشد و دکتری و پسا دکتری و پروژه های کوتاه و بلند مدت اساتید دارد. تحقیقاتی که در این آزمایشگاه صورت می گیرد : مطالعه فیزیولوژی بر روی انواع گیاهان زراعی و داروئی , بررسی میزان فتوسنتز گیاهان, تاثیر تنش های محیطی بر گیاهان, تولید متابولیت های ثانویه گیاهان , مطالعه در روش های کروماتوگرافی مایع گازی و ... بررسی مطالعات آنزیمی و مولکولی ,آنالیزهای مواد معدنی در گیاهان, مطالعه رنگیزه ها و متابولیت های ثانویه گیاهی, مطالعه ژئومیکس شامل: نگهداری مواد گیاهی در شرایط برودت و خالص سازی آن ها, مطالعه پروتئین ها و آنزیم های گیاهی.