بررسی روابط خویشاوندی گونه های گیاهی و طبقه بندی آنها با استفاده از روشهای بیوسیستماتیک گیاهی و مولکولی
 
این آزمایشگاه در طبقه اول ساختمان اصلی دانشکده قرار دارد و شامل ده دستگاه میکروسکوپ نوری و استریومیکروسکوپ سالم و فعال است. در این آزمایشگاه واحدهای آزمایشگاه ریخت‌شناسی و تشریح گیاهی، آزمایشگاه سیستماتیک گیاهی (1)، (2) و(3)، آزمایشگاه اکولوژی گیاهی و آزمایشگاه قارچ شناسی برای دانشجویان زیست گیاهی و آزمایشگاه مبانی گیاه‌شناسی برای دانشجویان میکروبیولوژی ارایه می‌شود.